Botoks bir çeşit toksindir. Doğru ellerde, yetkili ve uzman hekimlerce doğru uygulamalarda neredeyse çok ciddi bir yan etki ile karşılaşmaksızın kullanılabilir.


Botoks, 25 yıldır tıbbın hizmetinde, birçok hastalığın sağaltımında kullanılmaktadır. Yan etki ortaya çıksa da genellikle geçicidir. En sık görülen yan etki Botoks'un hedeflenmeyen kaslara da yayılarak geçici zaaf yapmasıdır. Örneğin; fazla dozda verilmesi durumunda veya uygulamanın yanlış bölgeye yapılması halinde "ptosis" adı verilen göz kapağı düşmesi problemi ortaya çıkabilir ve hastanın birkaç hafta rahatsız olmasına sebep olur. 

Daha da nadir görülmekle birlikte bildirilmiş diğer yan etkiler ise (kozmetik amaçlı kullanımlarda tarafımızca şimdiye kadar hiç görülmedi): baş ağrısı, kaşlarda düşme, grip benzeri şikayetler, diplopi-çift görme (genelde şaşılık-göz hastalıkları uygulamalarında), iğne bölgesinde hematom (çok nadirdir ve kan sulandırıcı ilaç kullanan veya kanama zamanı uzun kronik rahatsızlığı bulunanlarda) ve kızarıklık (neredeyse tamamı 1-2 saat içinde geçer), ağız kuruluğu, deri döküntüsü, var olan nörolojik hastalığın aktivasyonu vb. Bu etkiler genellikle geçici ve çok az vakada da birkaç ay süreli gözlenmiştir.